Cụ thể, với việc khai lệ phí trước bạ, Thông tư 05 của Bộ Tài chính quy định, tổ chức, cá nhân thuộc quản lý của cơ quan thuế có ôtô, xe máy chưa qua sử dụng (không bao gồm ôtô, xe máy được thừa kế, quà tặng) gồm cả tổ chức khai thay theo quy định của pháp luật, thực hiện khai, nộp hồ sơ khai lệ phí trước bạ tại Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế.

Theo hướng dẫn, người nộp lệ phí trước bạ ôtô và xe máy cần khai thông tin số Giấy chứng nhận chất lượng an toàn kỹ thuật và bảo vệ môi trường hoặc số Giấy chứng nhận chất lượng kiểu loại và các thông tin tại Tờ khai lệ phí trước bạ mẫu số 2 Phụ lục ban hành kèm theo Nghị định 140/2016 của Chính phủ về lệ phí trước bạ; Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế sẽ tự sinh mã hồ sơ khai lệ phí trước bạ.

Trường hợp khai lệ phí trước bạ tại cơ quan thuế, người nộp lệ phí trước bạ thực hiện khai, nộp hồ sơ khai lệ phí trước bạ tại Chi cục Thuế nơi đăng ký quyền sở hữu, quyền sử dụng xe theo quy định tại Nghị định 140 của Chính phủ về lệ phí trước bạ và các văn bản hướng dẫn thực hiện.

Cơ quan thuế tiếp nhận, kiểm tra hồ sơ và nhập đầy đủ thông tin khai vào hệ thống quản lý của Tổng cục Thuế. Hệ thống này sẽ tự sinh mã hồ sơ khai lệ phí trước bạ.

Cũng theo hướng dẫn của Bộ Tài chính tại Thông tư 05, việc nộp lệ phí trước bạ được thực hiện bằng các cách: Nộp theo hình thức điện tử của ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hay qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế; nộp tại quầy giao dịch của cơ quan Kho bạc Nhà nước; nộp tại quầy giao dịch của ngân hàng (bằng tiền mặt hoặc chuyển khoản).

Cùng với việc quy định cụ thể về nội dung dữ liệu và nguyên tắc trao đổi dữ liệu lệ phí trước bạ điện tử giữa Tổng cục Thuế và Cục Cảnh sát giao thông, tại Thông tư 05, Bộ Tài chính còn hướng dẫn chi tiết về trình tự tiếp nhận, xử lý dữ liệu lệ phí trước bạ điện tử cũng như việc tra soát, xử lý sai sót, điều chỉnh thông tin thu nộp lệ phí trước bạ.