Trông như một tảng san hô được đưa lên từ lòng biển, nhưng khối aragonit phân nhánh lại là một tạo vật của lòng đất. Mẫu vật địa chất độc đáo này được tìm thấy ở Vĩnh Thịnh, Lạng Sơn năm 1975.
Tinh thể thạch anh mọc ghép hiếm thấy được thu thập năm 1985. Các tinh thể thạch anh trong suốt có màu sắc đa dạng, được sử dụng làm đồ trang sức từ rất xa xưa, ngày nay là loại đá bán quý phổ biến nhất thế giới.
Các mẫu đá quý và bán quý như aquamarine, topaz, ruby, thạch anh... được thu thập tại Lục Yên, Yên Bái - thủ phủ đá quý của Việt Nam - năm 1992.
Sắc màu kiêu sa của chùm tinh thể corindon biến loại ruby, thu thập ở Lục Yên, Yên Bái năm 1992. Khoáng vật này có độ cứng rất cao, được dùng để chế tác đá quý cũng như ứng dụng trong công nghiệp.
Tinh thể thạch anh có độ pha lê cao, thu thập ở Thanh Hưng, Thanh Chương, Nghệ An năm 1986. Thạch anh có độ pha lê càng cao càng tinh khiết và giá trị càng tăng.
Tinh đám thạch anh thu thập ở Thạch Khoán, Phú Thọ năm 1998. Tinh đám thạch anh hay hốc thạch anh là sự kết tinh của thạch anh dưới dạng dải, đám với mật độ cao.
Tinh đám thạch anh là khoáng vật giàu giá trị thẩm mỹ, thường được chế tác thành vật dụng trang trí nội thất.
Mẫu chalcedon cắt đôi xếp cạnh nhau trông như một con bướm rực rỡ. Hiện vật thu thập ở Quỳ Hợp, Nghệ An năm 1992.
Một lát cắt trên khối serpentinit xù xì để lộ ra phần ruột xanh biếc quyến rũ. Mẫu vật được thu thập ở Suối Giàng, Văn Chấn, Yên Bái năm 2009.
Ngoài các mẫu địa chất thu thập trong nước, Bảo tàng Địa chất Việt Nam còn có nhiều mẫu vật độc đáo đến từ nước ngoài, ví dụ như mẫu đá agat đến từ Ural, Liên bang Nga này.
