Theo tài liệu của Phòng Thanh tra – Kiểm tra Cục Thuế tỉnh Ninh Thuận, vào tháng 10/2022, đoàn kiểm tra của cơ quan thuế đã tiến hành kiểm tra tại Công ty CP Xuân Thiện Ninh Thuận và Công ty CP Xuân Thiện Thuận Bắc. Kết quả kiểm tra cho thấy hai doanh nghiệp này có nhiều vi phạm về thuế.

Ngày 10/11/2022, đoàn kiểm tra đã lập dự thảo biên bản vi phạm hành chính, kèm theo dự thảo quyết định xử phạt, đề xuất truy thu và xử lý số tiền thuế vi phạm lên đến hơn 73 tỷ đồng. Trong đó, Công ty Xuân Thiện Ninh Thuận bị đề nghị truy thu hơn 47,4 tỷ đồng, còn Công ty Xuân Thiện Thuận Bắc hơn 26 tỷ đồng.

Tuy nhiên, dù hồ sơ trên đã được trình cho lãnh đạo Cục Thuế tỉnh Ninh Thuận, là người có thẩm quyền xử lý theo quy định pháp luật, nhưng trong suốt hơn hai năm (831 ngày), không có bất kỳ quyết định xử phạt hay truy thu nào được ban hành. Toàn bộ hồ sơ gốc liên quan đến vụ việc, bao gồm biên bản kiểm tra, báo cáo kết quả, dự thảo xử phạt… đều do ông Đặng Dũng trực tiếp lưu giữ từ ngày 11/11/2022.

Trước sự chậm trễ "bất thường", ngày 17/2/2025, Trưởng đoàn kiểm tra thuế Phạm Hồng Phương cùng hai thành viên trong đoàn là bà Phan Thị An và bà Võ Nguyễn Bảo Trân đã đồng ký văn bản gửi ông Đặng Dũng và Phòng Kiểm tra nội bộ, yêu cầu xử lý theo quy định pháp luật.

Văn bản nêu rõ căn cứ pháp lý để xử phạt và cảnh báo về nguy cơ hết thời hiệu xử phạt vi phạm hành chính. Cuối văn bản, ông Vũ Quốc Hiệp – Trưởng Phòng Thanh tra – Kiểm tra – cũng ghi bút phê: “Kính chuyển lãnh đạo Cục Thuế xem xét xử lý theo đúng quy định pháp luật để tránh thất thoát ngân sách nhà nước”.

Tuy nhiên, vụ việc tiếp tục bị “bỏ ngỏ”, trong khi đó người có trách nhiệm là ông Đặng Dũng, Phó Cục trưởng Cục thuế tỉnh Ninh Thuận đã được nghỉ hưu theo chế độ từ ngày 1/3/2025.

Sau khi hai tỉnh Ninh Thuận và Khánh Hòa sáp nhập, vụ việc tiếp tục được Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Khánh Hòa (trên cơ sở kế thừa chức năng điều tra từ tỉnh Ninh Thuận trước đó) xác minh và mở rộng điều tra. Căn cứ kết quả điều tra và tài liệu thu thập được, Công an tỉnh Khánh Hòa đã tiến hành khởi tố, bắt tạm giam ông Đặng Dũng.

Cùng với lệnh bắt tạm giam, cơ quan chức năng cũng đã thực hiện khám xét nơi ở của ông Đặng Dũng theo quyết định được Viện Kiểm sát nhân dân khu vực 5, tỉnh Khánh Hòa phê chuẩn.