Khó bú mẹ. Theo khảo sát mới đây, trẻ sinh mổ thường sẽ chậm bắt nhịp với cuộc sống hơn trẻ sinh thường vì có thể bé cũng sẽ chịu ảnh hưởng của một số loại thuốc trong quá trình mổ đẻ. Thêm nữa, việc sinh mổ cũng khiến mối quan hệ tình cảm giữa mẹ và con có phần hạn chế khi bé bú gặp bất lợi vì bé sẽ khó bú mẹ hơn và thời gian phục hồi của mẹ lâu nên con không được chăm sóc chu đáo từ mẹ trong những ngày đầu.
Dễ sinh sớm. Trẻ sinh mổ có thể gặp phải trường hợp chào đời sớm, đặc biệt trong những trường hợp xác định ngày dự sinh không chính xác, lúc này bé dễ gặp vấn đề về đường hô hấp, vàng da, mất nước, nhiễm trùng…
Bị ảnh hưởng bởi các loại thuốc. Cho dù ca mổ thường được tiến hành rất nhanh nhưng thuốc gây mê cho mẹ cũng rất dễ ngấm vào cơ thể trẻ. Trẻ bị nhiễm thuốc mê của mẹ có thể ngủ luôn, mất phản xạ khóc.
Khả năng miễn dịch thấp. Việc không đi qua đường sinh tự nhiên của mẹ khi chào đời bằng phương pháp đẻ mổ khiến phổi của trẻ không nhận được lực co thắt mạnh của cổ tử cung ép chặt để vắt sạch nước ối trong phổi. Vì lý do này nhiều bé còn tồn dịch phổi, dễ bị khò khè hoặc mắc các bệnh về hô hấp sau này.
Hệ miễn dịch lâu hoàn chỉnh. Nếu trẻ sinh thường chỉ mất khoảng 10 ngày để hệ miễn dịch hoạt động tốt thì trẻ sinh mổ phải mất có thể tới 6 tháng mới hoàn thiện.
Hệ tiêu hóa non kém. Ngoài hệ miễn dịch yếu kém, nghiên cứu của các nhà khoa học Phần Lan cũng chỉ ra rằng phương pháp sinh mổ còn ảnh hưởng đến cả hệ tiêu hoá của trẻ. Bé sinh mổ tiêu hóa kém dẫn đến những triệu chứng như: nôn trớ, táo bón, nôn ói, kém phát triển, tiêu chảy…
