HMC đã được Toà án Nhân dân TPHCM triệu tập tham gia phiên toà xét xử vụ án Nguyễn Thành Tài và đồng phạm bị truy tố về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí" với tư cách là người có quyền lợi và nghĩa vụ liên quan.
Vụ án này liên quan đến dự án đầu tư tại khu đất số 8-12 Lê Duẩn mà HMC đã tham gia vào năm 2010 và sau đó đã chuyển nhượng toàn bộ cổ phần trong CTCP Đầu tư Lavennue cho Công ty TNHH Đầu tư Kinh Đô. Ngày 1/10/2020, HMC đã nhận được bản án số 420/2020/HS-ST ngày 20/9/2020 của Toà án Nhân dân TPHCM.
Theo đó, HMC phải nộp lại số tiền 50 tỷ đồng thu được từ việc chuyển nhượng cổ phần, để tịch thu sung ngân sách Nhà nước. Đồng thời, HMC được quyền liên hệ cơ quan thuế để hạch toán lại số thuế thu nhập doanh nghiệp đã nộp 12,5 tỷ đồng.
Khoản đầu tư này của HMC đã khiến công ty phải dành một khoản tiền dự trữ khoảng 30 tỷ đồng trong khi hoạt động kinh doanh đang ngày càng đi xuống. Cụ thể, lợi nhuận sau thuế năm 2019 của HMC lao dốc 88% xuống còn hơn 11 tỷ đồng do quý 4 lỗ hơn 18 tỷ đồng; còn 6 tháng 2020 chỉ lãi 14 tỷ đồng. Tại thời điểm 30/6/2020, lợi nhuận sau thuế chưa phân phối của HMC chỉ hơn 45 tỷ đồng.
Liên quan đến vấn đề thuế, ngày 09/09/2020, HMC đã nhận được quyết định xử phạt vi phạm hành chính về thuế của Tổng Cục Thuế.
Cụ thể, Công ty bị phạt hành chính gần 94 triệu đồng do khai sai dẫn đến thiếu số thuế giá trị gia tăng (GTGT), thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN), thuế thu nhập cá nhân (TNCN) phải nộp.
Ngoài ra, Công ty cũng bị truy thu hơn 446 triệu đồng tiền thuế gồm thuế TNDN và TNCN còn thiếu (đã bao gồm số tiền chậm nộp tính đến ngày 07/09). HMC sẽ tự tính và nộp thêm tiền nộp chậm tính đến ngày Công ty nộp đủ tiền truy thu vào ngân sách Nhà nước theo quy định. Như vậy, tổng số tiền HMC bị xử phạt và truy thu là 530 triệu đồng.