Cùng vụ án, C03 đề nghị truy tố 14 người về các tội "Buôn lậu; Vi phạm quy định về quản lý sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát lãng phí; In, phát hành, mua bán trái phép hoá đơn, chứng từ thu nộp ngân sách nhà nước; Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng".
Trong số này có ông Nguyễn Xuân Hanh - Tổng Giám đốc Công ty Công viên cây xanh Hà Nội; Đỗ Quang Tiến - Giám đốc Xí nghiệp cây xanh cây hoa cây cảnh và nhiều cán bộ thuộc Ban Duy tu các công trình hạ tầng kỹ thuật đô thị thuộc Sở Xây dựng Hà Nội, Công ty TNHH MTV Công viên cây xanh Hà Nội.
Theo kết luận điều tra, với cương vị Chủ tịch UBND TP Hà Nội, Nguyễn Đức Chung đã trực tiếp can thiệp, chỉ đạo xuyên suốt quá trình trồng mới, chăm sóc, cắt tỉa cây xanh ở thủ đô.
Tháng 2.2016, với mục đích can thiệp việc trồng cây xanh, ông yêu cầu "tạm dừng việc đấu thầu tại các quận, huyện và thu gọn đầu mối về Sở Xây dựng thực hiện".
Tại các cuộc họp sau đó, Nguyễn Đức Chung chỉ đạo áp dụng hình thức đặt hàng, trong khi có thể thực hiện đấu thầu. Nguyễn Đức Chung cho phép vừa thực hiện vừa hoàn thiện thủ tục.
Khi biết việc chọn nhà thầu thực hiện trồng mới, chăm sóc, cắt tỉa cây xanh phải đấu thầu, Nguyễn Đức Chung "chỉ đạo miệng" với Giám đốc Sở Xây dựng và Trưởng phòng Hạ tầng kỹ thuật đô thị Sở Xây dựng làm tiêu chí, tổ chức đấu thầu.
Chỉ đạo này bị cơ quan điều tra cáo buộc "mang tính áp đặt", buộc Sở Xây dựng phải giao cấp dưới đặt hàng trực tiếp với người quen của Chung là Bùi Văn Mận - Giám đốc Công ty Sinh Thái Xanh.
Hồi tháng 3.2016, khi đang trốn nợ ở Lâm Đồng, ông Mận được Chung gọi ra Hà Nội "làm cây".
Tháng 2.2018, Sở Kế hoạch và Đầu tư và Sở Tài chính đề nghị thành phố phê duyệt kế hoạch đấu thầu trồng cây ven các trục đường quốc lộ, tỉnh lộ.
Nguyễn Đức Chung giao một phó chủ tịch Hà Nội xử lý. Cùng lúc với giao việc bằng văn bản, ông Chung chỉ đạo miệng, yêu cầu cấp phó làm tờ trình thay đổi phương thức lựa chọn nhà thầu từ đấu thầu sang đặt hàng. Từ đó để tạo điều kiện cho Công ty Sinh Thái Xanh thực hiện, kết luận điều tra nêu.
Theo C03, khi trồng cây theo chỉ đạo của Chung, các bị can thuộc Công ty Cây xanh, Công ty Sinh Thái Xanh, Ban Duy tu, Công ty VVFC, VFS đã thông đồng nâng khống giá; ban hành chứng thư thẩm định giá bằng với giá nâng khống.
Việc này được làm căn cứ để Ban Duy tu thanh quyết toán, giúp Công ty Cây xanh, Công ty Sinh Thái Xanh chiếm đoạt, thu lời bất chính, gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 34 tỉ đồng.
C03 kết luận, Nguyễn Đức Chung đã "thiên vị" cho các công ty, cá nhân có mối quan hệ thân thiết với mình để họ được hưởng lợi bất chính số tiền đặc biệt lớn.
Đổi lại, bị can Mận khai chi gần 1,2 tỉ đồng cho Chung tài trợ trồng cây ở Trường Mầm non Yển Khê và tại nhà bố đẻ của Chung.
C03 cho rằng qua kết quả xác minh và sổ sách theo dõi chi nội bộ của công ty ông Mận, đủ căn cứ xác định các khoản chi trên "là có".
Bị can Vũ Trung Kiên, Tổng Giám đốc Công ty Công viên cây xanh Hà Nội, khai đã chi 2,6 tỉ đồng cho ông Chung vào các dịp lễ, tết, từ năm 2016 đến 2020.
Cựu Chủ tịch TP Hà Nội phủ nhận các thông tin trên, khẳng định "không nhận khoản tiền này" từ ông Kiên, cũng không yêu cầu "trồng cây ở đâu". Chung khai đều đã trả tiền khi mua cây của ông Mận.
Đây là vụ án thứ 4 Nguyễn Đức Chung bị xử lý. Cựu Chủ tịch Hà Nội đang thi hành tổng cộng 12 năm tù tại 3 vụ án: chiếm đoạt tài liệu mật liên quan vụ án Nhật Cường, mua sắm chế phẩm Redoxy-3C, can thiệp đấu thầu tại Sở Kế hoạch và Đầu tư Hà Nội.