Theo đó, ngày 23/12/2019, Cơ quan An ninh điều tra Công an TPHCM đã ra quyết định khởi tố vụ án, quyết định khởi tố bị can và ngày 26/12/2019 đã thi hành lệnh bắt tạm giam đối với Trần Công Thiện (SN 1965, ngụ quận Gò Vấp, nguyên Tổng Giám đốc) và Nguyễn Văn Minh (SN 1957, ngụ quận 5, nguyên Chủ tịch Hội đồng thành viên Công ty TNHH MTV Đầu tư - Xây dựng Tân Thuận) để tiến hành điều tra về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí" quy định tại Điều 219 Bộ Luật hình sự năm 2015, sửa đổi bổ sung năm 2017.
Các quyết định khởi tố và lệnh bắt tạm giam đã được Viện Kiểm sát nhân dân TP HCM phê chuẩn.
Kết quả xác minh, điều tra ban đầu xác định Thiện và Minh đã có dấu hiệu vi phạm trong việc ký hợp đồng chuyển nhượng, hoán đổi phần vốn góp, chuyển nhượng một phần dự án Khu dân cư ven sông, phường Tân Phong, quận 7 và khu đất tại dự án Khu dân cư Phước Kiển tại xã Phước Kiển, huyện Nhà Bè do công ty TNHH MTV Đầu tư - Xây dựng Tân Thuận làm chủ đầu tư không đúng quy định pháp luật gây thiệt hại đến tài sản Nhà nước.
Hiện Cơ quan An ninh điều tra Công an TPHCM đang tiếp tục điều tra làm rõ vụ án để xử lý theo đúng quy định của pháp luật.